目前煤電并軌政策已經確定，但電煤價格并軌后煤電矛盾依然會存在，如何使改革不再反復，關鍵是要同步推進煤電產業鏈的系統性改革，借助并軌的有利時機，實施煤炭供應、運輸、電力等多領域的配套改革，從根本上解決煤電矛盾。
　　電煤價格雙軌制是為解決煤電矛盾所采取的臨時性措施，多年來煤炭企業要求并軌的呼聲一直很高。
　　近期煤炭價格回落是推進電煤價格并軌的有利時機
　　電煤價格并軌是推進煤炭價格市場化改革的重要舉措
　　電煤價格雙軌制的存在造成了很多弊端，催生了一些非正常行為，如煤炭企業摻假、做假、倒賣合同煤等等，不僅擾亂了正常的煤炭市場，也增加了電力企業的實際購煤成本；其次，受煤炭企業抵觸，重點合同煤的兌現率逐年降低，煤電“頂牛”情況屢屢出現；再者，雙軌制也造成了燃煤發電企業間的不公平，2011年實際兌現的重點合同煤量僅占電煤全年總消費量的30%左右，大部分燃煤發電企業享受不到低價供煤。電煤價格并軌可切實消除這些弊端，破除煤炭價格市場化改革的最后一個障礙，有助于形成規范、健康的煤炭市場體系。
　　近期煤炭價格回落有利于增強煤電雙方的并軌共識
　　當前，煤炭行業整體效益大幅下滑，一些包袱重、開采條件差的煤炭企業甚至出現了巨額虧損、發不出工資等現象；燃煤發電企業經營狀況則普遍改善，盡管一些電廠的發電利用小時數呈小幅下降，但煤炭價格下跌所帶來的成本節約大大高于收益損失。在此情況下，煤炭企業要求通過價格并軌來完善市場的呼聲非常強烈，發電企業也要求按市場價格而非重點合同煤價進行交易結算。中長期來看，對未來煤炭市場供需相對寬松的預期，也增強了煤電雙方對價格并軌的共識。
　　煤電企業間自主價格的長期協議應成為電煤供應的主要模式
　　上下游企業間的長期合同是國際上解決大宗資源供應的普遍做法，如美國國內的煤電關系模式基本都為煤電企業間的長期協議。相比于政府主導的重點合同，企業間的長期協議更具靈活性和約束性，雙方的權利義務也將更加明確。受煤炭運輸格局鎖定的約束，長期協議取代重點合同，并不會對電煤供求格局產生沖擊，除少量交易可能重構外，絕大部分煤炭供求仍會在原交易雙方之間完成，只是價格由過去的政府指導轉為雙方自主確定。
　　電煤價格并軌并不能從根本上解決煤電矛盾
　　煤電矛盾本質上是市場煤與計劃電的矛盾
　　市場煤與計劃電的矛盾是我國煤電產業矛盾的根本，過去近10年煤炭價格的大幅上漲又使得這一矛盾尖銳化。我國從1993年開始推進煤炭價格市場化改革，逐步放開了冶金用動力煤、化肥生產用煤、計劃外電煤等價格，2002年又進一步取消了計劃內電煤的政府指導價，而電價一直都沒有放開，這就產生了市場煤與計劃電的根本性矛盾。2004年以后煤炭價格開始趨勢性上漲，從不到300元／噸一路走高到2011年的近900元／噸 （秦皇島5500大卡動力煤），而同期燃煤電價上漲幅度較小（以廣東為例，2004年新投產未安裝脫硫設備的燃煤機組上網電價為40.5分／千瓦時，2011年為50.6分／千瓦時，上漲幅度僅25%），成本傳導機制缺失使得大部分燃煤發電企業連續多年嚴重虧損，加劇了煤電矛盾。為保障燃煤發電企業利益，我國曾于2004年底推出了煤電價格聯動機制，但由于煤炭價格漲幅過大，電價又關乎下游所有工商業和城鎮居民的生產生活成本，上調空間受限，聯動機制在實施了幾輪以后不得不被擱置，最后的辦法只能是對電煤價格的干預。
　　電煤價格并軌不能改變長期存在的煤電困境
　　電煤價格并軌后，煤炭企業可以獲得煤炭價格上漲帶來的全部“好處”，但如果沒有確立向下延伸的傳導機制，燃煤發電企業將承擔漲價帶來的全部損失。可預計的情況是，煤炭市場價格一旦再次大幅上漲，燃煤發電企業經營狀況將會再次惡化，政府又將不得不再次干預電煤價格。地方上過去也同樣有電煤價格放開后又收回的經歷，如貴州省曾就電煤價格改革做過一些嘗試，在2007年7月放開了省內電煤價格。不再實行政府指導價，改由市場直接調節，但此后由于省內煤炭價格大幅上漲，電廠虧損嚴重，政府不得不在2008年底又采取價格限制。可見，如果沒有配套改革和措施，僅僅取消雙軌制，并不能從根本上解決長期存在的煤電困境。
　　要使改革不再反復需同步推進煤電產業鏈的系統性改革
　　長期協議應保留重點合同的運力保障功能
　　在現階段鐵路運力仍相對緊張、市場化分配機制仍未建立的情況下，保留對重點煤電企業間長期協議的運力保障有利于穩定電煤供應。具體辦法可參照重點合同的簽訂辦法，由鐵路部門作為第三方參與長期協議的簽訂；也可由煤電雙方簽訂長期協議后，交由政府主管部門與鐵路部門統一協調給予保障。
　　加強煤運基礎設施建設，先行推進煤炭鐵路運輸體制改革
　　鐵路運力整體不足和結構性“梗阻”是造成前期煤價非理性上漲的一個重要因素。破除鐵路運輸瓶頸一方面要加強基礎設施建設，重點保障列入“十二五”規劃的煤炭鐵路、公路建設，更重要的是應盡快啟動鐵路運輸的市場化改革，盡早實現政企分開和政資分開，并進一步推進產業組織結構調整。煤炭鐵路運輸可以作為改革的試驗區，先行推進：一是改革鐵路建設的投融資體制，打破國家投資為主的單一模式，全面放開鐵道部對煤炭專線鐵路建設的控股權限制，實現煤炭鐵路投資主體多元化；二是改革鐵路系統的內部運行機制，實施多經治理、路運分離、調度下放和市場定價等多項改革措施，實現煤炭運輸效率的大幅提升和運輸成本的大幅下降。
　　盡快確定輸配分開模式，穩步推進電力市場化改革
　　我國電力市場化改革目標及電價形成機制遠景非常清晰，即在廠網分開、主輔分離、輸配分開的基礎上實現競價上網，形成競爭性的銷售電價和管制下的輸配電價。由于各方對輸配分開的不同認識，使得近幾年改革推進非常緩慢。國際上確實有不同的輸配分開模式，如法國是財務獨立，英國是分立，但無論何種模式，只要能夠做到輸配環節成本清晰、監管有力，都不會影響市場化電價機制的形成。當前我國應該盡快確定輸配分開模式，并把工作重點放到對輸配環節的監管和售電環節的市場化改革上來。售電環節的市場化改革可以借鑒其他國家從用戶側推進改革的經驗，按用戶的電壓等級高低逐級放開售電，實現一定電壓等級以上用戶的競爭性銷售電價。
　　近期可在電煤價格并軌的基礎上落實煤電價格聯動機制，煤電價格聯動如有困難，可繼續實施對燃煤發電企業的補貼機制，同時在全國范圍內推廣大用戶直供電，作為推進售電環節市場化改革的重要措施。